Дело в отношении Лысенко и семи предполагаемых членов банды, которую якобы возглавлял экс-чиновник, с апреля 2013 года слушается в Саратовском областном суде. Для участия в этом процессе были отобраны 12 основных и 12 запасных присяжных. Однако за девять месяцев в коллегии не осталось ни одного запасного присяжного, последний из них вошел в основной состав накануне удаления в совещательную комнату для вынесения вердикта.
Присяжные удалились в совещательную комнату 28 января, однако по окончании рабочего дня попросили перерыв до утра следующего дня. Однако утром один из присяжных не явился из-за болезни и коллегии грозил роспуск, однако судья "с учетом действующего законодательства, с учетом сроков рассмотрения дела" объявил двухнедельный перерыв.
Оперативники задержали Лысенко 28 ноября 2010 года, когда он еще был главой района. Следователи считают его лидером банды, еще восемь участников которой также были привлечены к уголовной ответственности — некоторым из них инкриминируется 12 тяжких и особо тяжких преступлений. Один из предполагаемых участников банды, Юрий Нефедов, заключил досудебное соглашение о сотрудничестве и был осужден на 8,5 лет колонии строгого режима.
Сам Лысенко обвиняется в семи преступлениях, в том числе в организации убийства в 1998 году в Энгельсе криминального авторитета Николая Балашова. Помимо Лысенко, под стражей находятся еще пятеро подсудимых, остальные двое — под подпиской о невыезде.